新安江上游流域总体水质为优下游的千岛湖湖体水质总体稳定保持为Ⅰ类，营养状态指数由中营养变为贫营养，与新安江上游水质变化趋势保持一致。生态环境部环境规划院的专项评估报告认为，新安江已经成为全国水质最好的河流之一。

新安江发源于安徽黄山市休宁县，进入浙江淳安、建德市的千岛湖，是浙江省最大的入境河流。水利部有关科研单位的调查数据显示，新安江安徽境内流长240多公里，流域面积占新安江全流域面积一半以上，年均出境水量高达70多亿立方米，占下游千岛湖年均入库水量的60%以上。