一、过滤

膜过滤是一种物理分离技术，根据膜的性质（例如，孔隙率）和液体含量（例如，粒度），液体的内含物通过或被膜排除。通过选择具有适当孔径的膜，可以过滤液体病毒样本以排除细胞和其他大型非病毒污染物。

二、核酸酶处理

衣壳和包膜为病毒基因组提供了额外的保护层，防止核酸酶降解。DNAse和RNAse通常用于消除外源核酸，同时受保护的病毒基因组保持完整。

三、苯酚/氯仿抽提

可以使用苯酚/氯仿提取方法从病毒RNA基因组中分离宿主来源的基因组DNA和小RNA，该方法涉及将DNA 和RNA分别分为有机相和水相。首先，通过向含有核酸的样品中加入酸性苯酚和酸性缓冲液来产生单相溶液。氯仿的加入创建了一个双相系统，其中DNA和蛋白质分配到下层有机相，而上层水相保留RNA。水相可以另外用异丙醇处理，并通过基于硅胶柱的纯化处理，以提取总 RNA 或单个小RNA（miRNA、tRNA、5SrRNA、5.8SrRNA）和大RNA（mRNA、18SrRNA、28SrRNA） ， snRNA) 分子，这取决于乙醇的浓度。

四、离心

低速离心：（例如，4℃下6000 ×g10分钟)是一种简单方便的病毒净化方式。细胞和大的细胞碎片被沉淀，上清液中悬浮的病毒粒子可以进行更严格的纯化。

超速离心：病毒的大小和密度不同于细胞器（例如线粒体、核糖体、细胞核）、生物大分子（例如 DNA、RNA、蛋白质）和污染病毒样本的其他宿主成分。超速离心利用这些物理化学特性将病毒与非病毒元素分离。这种分离通常是通过结合蔗糖和氯化铯密度梯度来实现的。在超速离心之前，细胞碎片在初始离心步骤中被清除。通过首先应用蔗糖密度梯度离心进一步去除剩余的杂质，该离心基于颗粒的 S 值或沉降系数进行分离。然后将氯化铯密度梯度平衡离心（根据其浮力密度分离颗粒）应用于所得病毒粗级分，以获得纯化的病毒片段。

五、沉淀

储存或下游应用（如感染和病毒基因组分离）通常需要浓缩的病毒制备物。已经开发出沉淀方法，以根据在无机盐或聚醚化合物（例如硫酸铵、PEG-6000）溶液中的溶解度，快速、轻松且廉价地浓缩病毒并去除杂质。例如，据报道，在40%的饱和度水平下，硫酸铵会从补充有 10% FCS 的细胞培养基中诱导病毒沉淀，其中大部分(85%) 的蛋白质保持溶解状态。

六、柱层析

有多种色谱树脂（例如，蛋白