可以的啊，有很多工作就是通过通知的方式发出去的，通知可以对单位内部发送，也可以对平行机关发送，只要是涉及到具体的工作的都可以用通知的形式，所以平行机关用通知也是正常的方式，如果是有歧义也可以用抄送的方式。