东晋咸和六年（公元331年），东莞立县，初名宝安。唐肃宗至德二年（757年）更名东莞，县治置于涌（今莞城）。以东莞作县名由此始。历史上东莞的莞香树受虫蛀或人式砍伤后，由木质分泌而出，经多年沉积而成，有特别香气，故名“沉香”。

今香港新界沙田、大屿山等地，古属东莞，亦产莞香。