行政后勤编制和事业编制的区别在于行政后勤编制属于工人编制，而事业编制则属于干部编制。因此两种编制的人员在公司待遇方面也存在不同。相对来说，事业编制的待遇起点更高。此外，行政后勤编制的人员不用评定支撑，而是凭借工龄进行工资建设，而事业编制人员必须通过评定职称来提升工资。