1、新审批的宅基地。如果是新申请建造房屋，必须将老的房屋宅基地退还给村集体，否则新的宅基地是不能确权的。如果想给新宅基地确权，也要通过分户(父母与成年儿女分立户口)来确权
2、修建在农村规划范围外的房屋。各个地方都有农村居住区的规划区域，农民建房要在规划的区域内，否则政府部门是不给确权的
3、改变宅基地使用性质。农民申请的宅基地只能用来建造房屋，如果用作其他用途，不能确权
4、买卖得来的宅基地。农民只拥有宅基地的使用权，买卖宅基地的行为不具备法律效力，所以，不能确权
5、宅基地存在归属争议、手续不全。只有争议解决或补全手续后，政府才会给予确权
6、非法占用的宅基地。我国法律规定，农村实行一户一宅的规定，一户一宅外多出的宅基地，除符合分户条件与合法继承的，是不予确权的。宅基地面积严重超标的，也是不予确权的。
7、违规占用农用地建设的房屋。此外，非法占有耕地建房的宅基地，这种更不会给确权，还有可能会被处罚，要求恢复耕地。
8、城市户口到农村建房现在按照相关的规定，城市户口是不能到农村建房、买地等，现在农村宅基地已经是三权分立了，把使用权分离了出来，当然城市户口资本可以进行资金投资，但是买房、买地就不能，如果出现这样的情况将会被处罚或者直接拆除，想房屋确权就更加不要想了。
9、非村集体成员或者不合法建设按照相关规定现在农村宅基地、房屋是不能与非村集体成员进行买卖的，如果特殊情况只能进行与村集体成员进行交换或者出售，还有另一种情况就是非法建设房屋，一般分为两种情况，一个是非法农业用地上建房，还有就是没有经过任何审批就私自建房，以上情况房屋都是不能进行相关的确权。
10、一个户口多个宅子现在按照相关规定，一个户口只能确权一处房屋，拥有一户多宅的家庭除非特殊情况可以确权，比如：以前遗留下来或者继承的房屋，其它多余的房屋、宅基地如果是私自开垦建设没有合法程序，是不能进行确权工作。
