1、个体微小，结构简单在形态上，个体微小，肉眼看不见，需用显微镜观察，细胞大小以微米和纳米计量。

2、繁殖快生长繁殖快，在实验室培养条件下细菌几十分钟至几小时可以繁殖一代。

3、代谢类型多，活性强。

4、分布广泛有高等生物的地方均有微生物生活，动植物不能生活的极端环境也有微生物存在。

5、数量多在局部环境中数量众多，如每克土壤含微生物几千万至几亿个。

6、易变异相对于高等生物而言，较容易发生变异。在所有生物类群中，已知微生物种类的数量仅次于被子植物和昆虫。微生物种内的遗传多样性非常丰富。