1952年，原河北农学院、平原农学院的畜牧兽医系和山西农学院的兽医专业整建制迁至归绥。1999年，内蒙古农牧学院和内蒙古林学院合并组建内蒙古农业大学。内蒙古农业大学硕士研究生教育始于1981年，首批设置草业科学和基础兽医学2个硕士点博士研究生教育始于1993年，设置草业科学和动物营养与饲料科学2个学科。博士后招生始于2001年，设置畜牧学科博士后流动站。