南通市辖4个区、1个县、代管3个县级市。

　南通市区有崇川区、港闸区、通州区，海门区和富民港办事处（与南通经济技术开发区管委会合署办公），下辖如东县、启东市、如皋市、海安市。有镇65个、街道37个，行政村1301个，社区624 个，场圃6个。