开平碉楼与村落的建筑大多已经荒废，散落在村落中。保护区的核心建筑有着合理的保护措施，由于这些建筑大多有近百年的历史，出现了不同程度的破损，其中大量问题是自然损坏，问题主要有墙面开裂、构件缺失、楼层渗水等造成的损毁。

这些问题产生的主要原因是这些建筑大多年久失修，自然损坏严重。个别建筑由于人为的进行改造和加建对建筑也造成了一定的破坏。