钢之炼金术师》中的炼金术是一种能够改变物质的构成与外形，并且制造出另一种物质的技术。基本原则是等价交换，原材料与炼成的物质的质量与元素（原子）与必须是相同的，所以无法用水炼出金属（也许能通过多重的转化来获取新的原子或通过更加深层的微观粒子来炼成，以此做到用水炼成金属）。

不过因为大地中有多种金属元素（铝、铁等），所以大多数格斗派的炼金术师都可以就地取材，制造出多种武器，爱德华的怪异武器也是这样诞生的。

亚美斯多利斯的炼金术以军用为主，曾经在伊修瓦尔内乱中投入国家炼金术师作为兵器，对战争的提早胜利起了重要作用。炼成的过程分为三步：理解、分解、再构成。