公积金余额还款没有限制次数，一年可以还无数次，为了方便公积金余额还款，可以到公积金管理中心办理公积金自动还款，就是只要公积金账户有钱就可以给还上公积金每月还款额，自己掌握好，如果公积金余额不足，可以存到公积金贷款账户足够还款的钱。