女子炸弹部队3狼穴日军侵华战争全面爆发为巩固占领，日军决定成立细菌武器工厂。女子行动队借机除掉731部队的研究员，并销毁新型细菌武器。成功铲除日军尾随而来的杀手，顺利保卫马远山的安全。