鸣人被纲手关起来是第479集，在木叶大监狱中时不时就会有人口失踪事件，木叶需要人去调查，这时候纲手就让鸣人假装犯案进入大监狱调查人口失踪时间，鸣人外面假装偷袭雷影以后，鸣人被纲手关了起来，但是进入监狱以后为了防止扰乱，所有人都被封印查克拉，鸣人也就勉强能用一个分身。