旗木卡卡西在火影忍者动漫中是在第三百九十五集中死去的。

火影忍者动漫中佩恩六道入侵木叶村，打算抓住漩涡鸣人并抽取其体内的九尾，旗木卡卡西为了掩护猿飞木叶丸逃跑，随后和秋道丁次父子联手对战天道，然而最后确功亏一篑，力竭战死。