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水葫芦对藻类生长有克制作用。

其机制主要是由于水葫芦根系向水体分泌的有机物质能伤害和杀死藻类。用水葫芦种植水培养藻类，使藻类的光合作用速率显著降低，叶绿素a破坏，细胞还原TTC的能力下降。在荧光显微镜下可看到藻细胞从鲜红色变为淡蓝绿色。