根据国家相关法律的规定，自建房屋如果没有房产证，房屋也是不会受到法律保护的，不过农村自建房可以通过以下两种方式来办理产权证：

1、申请宅基地使用权。

2、经过规划建设办批准设立的合格房屋，可以向当地的房管所提出申请，并且提交土地使用证等相关资料，在审批合格后予以颁发房产证。