因河水含腐殖质多，水色发黑得名。在中国古代文献中，黑龙江有黑水、弱水、乌桓河等诸多别称，公元13世纪成书的《辽史》第一次以“黑龙江”来称呼这条河流。满语音“萨哈连乌拉”，其中“萨哈连”意为“黑”，“乌拉”意为“水”。蒙古语则称“哈拉穆连”。俄文音“阿穆尔”或“阿母”（Amure），成为世界上大多数国家认同的名称.