FBI的工作分成三大门类：
刑事侦查
反间谍
反恐怖
刑事侦查主要是针对违反联邦法律的案件，以白领犯罪为主，和中国公安经侦的工作有些类似，此外还有跨州案件、连环杀人案、毒品案件、有组织犯罪案件等
工作基本上和刑事警察类似
反间谍案件相对要保密一些，而且反间谍案件耗时很长，一般的刑事案件可能几个月就破了，但反间谍监视工作经常要持续多年，甚至连续监视一个人长达十年也不是什么稀奇的事儿
正因为这个原因，更多的特工希望从事刑事侦查工作，起码破了大案还能上新闻，不用做无名英雄
FBI的反间谍工作并不仅仅是对已发生的间谍案件进行侦查，它同时也是主动展开情报工作的
按照美国情报机构的分工，只要是在海外发展情报对象的工作全是由CIA负责
但同时，只要是在美国境内发展情报对象的工作全是由FBI负责
也就是说，FBI的反间谍部门也具有对外情报职能，只不过它只能在美国境内从事对外情报工作，不能在海外进行此类工作
所以，以冷战时期的美苏间谍战为例，FBI的工作不仅仅是在美国抓苏联间谍，它还会去主动在美国境内策反苏联人，以前还专门在苏联大使馆下面挖过一条地道用于窃听，可惜被它的内鬼Robert Hanssen把这一消息出卖给了苏联人
而一旦由FBI在美国策反的苏联人回国或者到别的国家工作，FBI就要把这个人转交CIA继续管理和使用，不能再由FBI直接指挥这名苏联人在海外为美国工作
反恐怖案件的侦查工作和反间谍工作非常相似，工作特点也差不多
相比之下，负责刑事侦查工作的特工最为危险，因为他们破的案子里会涉及到抢劫联邦银行等暴力案件，会发生与歹徒交火等情况，所以FBI历史上殉职的特工大部分是负责刑事侦查的
反间谍案件的嫌疑人一般暴力性不强，即使是二战期间FBI抓捕乘潜艇潜入美国的德国间谍时也是零伤亡
反恐怖案件抓捕的次数并不多，所以目前也没出现过重大伤亡事件，不像刑事侦查工作，仅1986年的迈阿密枪战就造成2名FBI特工殉职，5名受伤（歹徒只有2人）
FBI招收的都是高学历人才，特别看重律师、财务、外语、计算机等背景的报考者
总体上讲，FBI的工作的危险性要比地方警察小很多，殉职人数也要少得多，因为他们直接负责的暴力案件只是少数
