伊犁哈萨克自治州下辖两个地区（阿勒泰地区、塔城地区）和州直（原伊犁地区）3市（伊宁市、奎屯市、霍尔果斯市8县（伊宁县、霍城县、察布查尔县、昭苏县、特克斯县、巩留县、尼勒克县和新源县），是全国为数不多的几个副省级单位之一，也是新疆维吾尔自治区五个自治州中最大的一个自治州。所以伊犁行政归新疆维吾尔自治区管理。