我国基层政府主要呈现为乡、镇、街道三种不同的基层政权组织。因此，基层政府机构应依据治理环境和任务的不同而具体设置。然而，基层政府的机构设置往往简单复制上级政府的机构设置，缺乏符合自身发展的体制设计，从而加剧了科层制结构与功能之间的张力。

此外，由于条块分割的问题，部分拥有执法权的机构是上级政府下派，其人财物均归上级管辖。尽管近年来属地化管理步伐加快，这些“条条”机构开始逐步下放权力给基层政府，但仍存在权力下放不彻底的问题。