阿富汗人的民族起源问题是一个非常重要但又极为困难的问题。要解决这一问题需要完整的综合文献资料（包括语言学、考古学、人类学的资料），但这方面的资料是极其缺乏的。
阿富汗人基本上属于长头人种。这种长头人种的欧罗巴人种居民自古就居住在南阿富汗地区。在锡斯坦发现的青铜时代的墓葬中出土过此类人种。短头欧罗巴人种是居住在阿富汗的塔吉克人，但在大夏（巴克特里亚）北部未发现古人类学的材料。不过，南阿富汗部族的卡卡尔人、塔林人属短头人种，其特点接近于俾路支人普遍具有的人类学类型。在东部许多阿富汗部族中，明显地表现了同北印度人的混合痕迹。同时，吉尔查伊人显然可见蒙古人的特点。这些不多的人类学资料可以证明，阿富汗部族身体类型的多样性。
