1、岭南军团
秦统一六国后，10万秦军在屠睢统帅下，进击南越，然而战争进行的并不顺利，秦军损失惨重，主帅屠睢更落得惨死。于是在公元前214年，秦始皇命任嚣、赵佗再次出征，终将南越纳入秦帝国的版图。为了巩固这一地区，10万秦军和大约40万徭役、民夫就地扎根。
4年后，秦始皇病逝，秦帝国爆发内乱，然而岭南军团的主帅赵佗却封锁了五岭边界，没有北上救援。就这样，50万南下秦人坐视了秦帝国的覆灭。
而关于赵佗见死不救的原因，大体有以下几个解释：1.赵佗有割据之心2.岭南为新附之地，秦军一旦离开，岭南将再次脱离华夏3.楚地为秦末叛乱最激烈的地区，以材官(步兵)和楼船士(水兵)为主的岭南军团，没有足够的骑兵突破楚国封锁，进入中原战场。
岭南宾服的当年，秦始皇曾从中原向岭南地区大批移民。二世继位后，从未有过召回岭南军团的意向，而秦将章邯在进入楚地连破陈胜、项梁后，也从未派人去联络赵佗夹击叛军。据此推测，第2种解释似乎可能性更大。
2、长城军团
长城军团是秦军的精锐，《史记》曾载，长城军团巅峰时有兵力30万，皆为久经沙场的骑马控弦之士。蒙恬、扶苏统帅这支军队，在不到一年的时间里，攻入匈奴腹地700余里，成功收复河套，战功彪炳。
蒙恬被设计害死后，副将王离成为了统帅。公元前208年，20万长城军团南下巨鹿平叛，然而项羽却突破了章邯防线，致使长城军团的粮道被切断。在诸侯合围之下，兵疲少粮的长城军团被歼灭，主帅王离被俘，副将涉间、苏角战死。
长城军团覆灭的主要原因是军队的灵魂人物—蒙恬被杀。此外，章邯在面对项羽时的犹豫不决，直接导致了长城军团的粮道被切断。
3、骊山军团（刑徒军）
骊山军团是秦末战乱时最新组建的军团，它的主要兵员是原骊山的刑徒。公元前209年，陈胜起义爆发，数月间，陈胜部将周文就突入关中腹地，逼近咸阳。秦二世听从少府章邯建议，从70万骊山刑徒中筛选出20万人，组建了骊山军团。
这支由犯人、役夫、原六国军人组成的军队，爆发出了惊人的战斗力。仅在1个月内就击破了周文的数十万大军，3个月内灭掉了陈胜的张楚，又先后击杀魏王田儋和楚将项梁。到公元前207年初，黄河南岸的主要叛军已基本被歼灭。可惜由于章邯的指挥失当，骊山军团未能顶住项羽的猛攻，导致秦军精锐的长城军团被歼灭。畏惧赵高迫害的章邯，最终选择了投降。随后，20万人的骊山军团在新安被项羽坑杀。
4、关中军团
关中军团是秦帝国最后一道防线。这支军队由郎中令军(负责守卫皇帝)、卫尉军(负责守卫皇城及咸阳)、中尉军(负责守卫咸阳外围腹地)，人数不多，仅有5万人，但却是秦军最善战的军队，兵员来自关中地区，对秦王朝忠心可靠。
骊山军团出关平叛后，关中军团出于卫戍咸阳的需要，并未出关。为了有效掌控这支军队，赵高在任郎中令的同时，让女婿阎乐任咸阳令，将关中军团进行了分拆，致使战斗力被大幅削弱。
公元前207年8月，刘邦抢先攻入关中，秦王子婴下令关中军团前往阻击，实力大不如前的关中军团在峣关一战被刘邦击败。子婴见大势已去，出城投降。而关中军团的余部也并入了刘邦麾下，成为日后击败项羽的主力。
