1、日本驻上海总领事馆
日本国驻上海总领事馆是日本国在中国上海设立的总领事馆，位于上海市万山路。
该馆领区为：上海、江苏、安徽、江西。
2、日本驻广州总领事馆
日本国驻广州总领事馆位于广州市环市东路368号花园大厦，总领事是田尻和宏。
办事处管辖地区：广东省、海南省、福建省、广西壮族自治。
3、日本驻沈阳总领事馆
办公处：沈阳市和平区十四纬路50号。
办事处管辖地区：辽宁省、吉林省、黑龙江省 。
4、日本驻重庆总领事馆
日本国驻重庆总领事馆是日本国驻重庆的外交机构，位于重庆市渝中区邹容路68号。
1998年3月设立日本国驻华大使馆领事部驻重庆办公室，2005年1月1日升格为日本国驻重庆总领事馆。是日本国在中国内陆地区设立的唯一领事机构。
办事处管辖地区：重庆市、四川省、贵州省、云南省 。
5、日本常驻大连领事办公室
办事处管辖地区：大连市。
6、日本驻青岛总领事馆
2009年1月1日本驻青岛总领事馆正式开馆，这是新中国成立后第二家在青岛设立的外国总领事馆。总领事馆办公地点暂定在香港中路的颐中皇冠假日酒店六楼，开馆典礼将在各项工作步入正轨后择日举行。
1月5日起，日本驻青岛总领事馆开始受理在青日本人的各项业务，2009年5月开办签证。
日本驻青岛总领事馆受理出国留学、劳务输出、探亲等签证业务。
办事处管辖地区：山东省、
7、日本驻香港总领事馆
办事处管辖地区：香港特别行政区、澳门特别行政区 。
