星汉灿烂中的凌不疑最后的结局是回到了京城，并且他被文帝封为了异性王，和女主角程少商结为了夫妻，获得了一个圆满幸福的结局，可以说凌不疑是苦尽甘来，在经历了全家被灭的惨状后，他隐忍十年之久，最终杀死凌家满门复仇，虽然被文帝发配边疆五年，但是这也让他经历了考验，获得了成长，最终立下了大功，成为了朝廷的异性王。