亚坦尼斯在艾尔上方集结军队,准备进行艾尔夺回战,泽拉图知晓了预言,前来阻止亚坦尼斯。亚坦尼斯知道泽拉图冒险前来必有道理,可是此时箭在弦上不得不发,他依然率军进攻了艾尔。在艾尔登陆战获得了全面胜利,星灵仿佛获得了夺回家园的希望。此时,泽拉图告知了亚坦尼斯他所知道的真相,用来净化刀锋女王的萨尔那加神器是一个钥石,是打败埃蒙的关键。于是他们决定分头行动:亚坦尼斯率领黄金舰队留守并清理艾尔,泽拉图去找吉姆雷诺索取钥石。

可是情况有变,泽拉图正准备出发时,虚空追猎者号被摧毁,席伦蒂斯告知泽拉图亚坦尼斯在卡拉中失去了联系。泽拉图动身寻找亚坦尼斯,可是发现所有的卡拉星灵全部被一股邪恶力量控制了,连之前联络的席伦蒂斯一时间也失去了消息,于是泽拉图决定孤军深入探寻真相。泽拉图找到亚坦尼斯时,亚坦尼斯已经被埃蒙完全控制了。泽拉图想切断亚坦尼斯的神经束,亚坦尼斯二话不说立刻向泽拉图痛下杀手。泽拉图与之交战,却始终没有机会触碰到他的神经束。于是泽拉图下定决心,用身体硬接了亚坦尼斯的致命一击,利用这个机会切断了亚坦尼斯的神经束。亚坦尼斯恢复意识,而泽拉图则陨落牺牲。

亚坦尼斯佩戴了泽拉图遗留下来的灵能之刃,切断了一部分人的神经束,与未被控制的所有星灵,启动了亚顿之矛世界舰,逃离了母星。在亚顿之矛上有大量沉睡者的星灵军队,亚坦尼斯切断了他们所有人的神经束,唯有一人例外,此人正是保存者洛哈娜,洛哈娜认为自己可以抵御埃蒙的腐蚀,坚持要维持卡拉连接,亚坦尼斯只好观察一阵再说。亚坦尼斯率军前往了夏库拉斯,发现夏库拉斯上的艾尔传送门已经打开,大量异虫涌入星球,夏库拉斯已经沦陷。族长沃拉尊决定毁灭夏库拉斯,亚坦尼斯设计以牺牲夏库拉斯为代价毁灭艾尔的大量异虫。在十多亿异虫入侵后,亚坦尼斯过载了夏库拉斯上的萨尔那加神庙,用之所有的能量引爆了夏库拉斯,十多亿异虫和夏库拉斯同归于尽。

亚坦尼斯又来到了克哈寻找吉姆雷诺索取钥石,发现克哈正在内战中。经过调查,原来是莫比亚斯基金会的残党与帝国军在战斗,还夺走了钥石。亚坦尼斯帮助帝国军队摧毁了莫比亚斯基金会的部队,并从他们手中夺回了钥石。钥石被交给亚顿之矛上的相位技师凯拉克斯研究,他发现这钥石是很久很久很久之前的太古之物,并非人类所说的近代产生的物体,具体作用尚未可知。期间,洛哈娜被埃蒙控制了身体,洛哈娜虽然平时可以抵抗埃蒙的意志,但是埃蒙还是可以入侵洛哈娜的身体