星汉灿烂中的凌不疑和程少商分手的原因是：第一个原因是凌不疑再他们成婚前三天杀死了凌益满门，深深的伤害了程少商，让他们的婚礼荡然无存，第二个原因是凌不疑始终瞒着程少商自己的身世，这让程少商非常的伤心，自己的爱人不相信自己也让她没有安全感，于是他们在凌益满门被灭的当夜就提出了退婚。