行政事业单位部门预算按照“二上二下”预算编报程序完成。
“一上”——单位编制预算建议数，上报主管部门：报送部门人员、资产等基础信息，为编审基本支出预算提供依据；按项目库管理要求，报送项目支出需求，项目库应根据单位工作计划参考上年项目资金规模填报。
“一下”——财政部门下达预算控制数，部门单位根据控制数及部门预算项目建议修改调整形成预算草案。
“二上”——部门单位上报预算草案，并报送预算编报说明。
“二下”——财政部门完成对各部门预算草案数据的审核，编制汇总形成本级财政部门预算草案。财政部门向本级党委、政府汇报预算草案，并报送本级人民代表大会审批。财政部门根据人民代表大会批准的本级预算草案，在规定期限内批复各部门预算。各部门自财政批复本部门预算之日在规定时间内，批复所属各单位预算。财政部门批复部门预算后，在规定期限内，相关部门向社会公开各自部门预算。
