我国漠河和俄罗斯的界河是黑龙江，和我国漠河隔江对望的是俄罗斯外贝加尔边疆区的阿穆尔州。

漠河地处黑龙江省北部。西与内蒙古自治区额尔古纳市为邻，南与内蒙古自治区根河市和呼中区交界，东与塔河县接壤，北隔黑龙江与俄罗斯外贝加尔边疆区和阿穆尔州相望，是中国最北端的县级行政区；地势南高北低，南北呈坡降趋势，属于寒温带大陆性季风气候。