富士GFX 100S还可以实现最高5fps的连拍速度，并且相机具有425点对焦系统，可以实现实时眼部追踪，以及视频拍摄时的眼部对焦。

中画幅相机并不是擅长高速对焦的机型，但是富士GFX 100S在高速连拍下，依然有不错的对焦成功率，足够应对商业摄影师抓拍的需要。而中画幅相机一般不会用于鸟类、体育摄影，这台相机可以实现1亿像素下5fps的连拍速度，也已经相当不错。

在对焦时，富士GFX 100S可以支持-5.5EV的弱光对焦性能。可以在光线不好时，也提供稳定的对焦表现。这个在风光摄影中尤为重要。