神墓讲述了主角辰南从神墓陵园中爬出，但发现自己已经死了一万年，在得知自己死后天地间发生巨变，昔日的神魔消失与天地间，后来主角白手起家，一步一步成长，踏上武学巅峰，前往天界，追寻父亲辰战以及自己万年来念念不忘的她，雨馨。

后随人们一起探求天地真相，得知世间天已变得不公，生灵涂炭，天作为天地间的统治者，由万民心中的意念所产生但经过无数年的放纵却变得自私、贪婪，视人命为草芥，这天已然不是众生心中的天了。

主人公追随独孤败天、魔主、辰家老祖等上古大能弑幽冥，战黄天最终斩青天于九层云颠之上最终千万仙武与修道者以生命为代价成功灭天。