1700年是清康熙三十九年，发生的历史事件如下：
正月
廿四日，以湖南、湖北钱多价低，命暂停铸钱。
三月
陕西贪污赈银案。陕西大灾，拨银五十万两赈济。其原任同州知州蔺佳选、蒲城县知县关琇、韩城县知县王宗旦等，侵吞籽粒银十一万两，初三日，命斩监候。原任巡抚党爱不将属员侵扣情弊确查题参著，已革职，其余有关各官俱降革有差。
初六日，四川巡抚于养志、提督岳升龙互相讦告，俱革职。
四月
本年二月，康熙帝曾巡阅永定河。是月十七日，再行巡视，命直郡王允提(皇长子)总领王公、贝勒暨八旗兵丁前往挑浚下桩。
六月
河道总督张鹏翮奏，已将黄河海口拦黄坝拆去，开浚河身，于五月初九日完工开放，冲刷泥沙，河水大通。初三日，赐名大通口。
七月
初三日，喇嘛商南多尔济奏，策妄阿喇布坦派乓往青海，理藩院拟复以无庸议，谕曰：“此事目前观之，虽属甚小，将来大有关系。”
九月
谕兴修水利不可太骤。御史刘珩疏请应令直隶巡抚李光地于近河地方引水种田。二十一日，谕曰：“现令引水耕种，水利一兴，田禾不忧旱潦，岁必有秋，其利无穷。但不可太骤耳!今若竟定一例，诸处克期齐举，该部复行催查，则事必致于难行矣。亦惟兴作之后，百姓知其有益，自然鼓劝，各相效法。于是因地制宜，设法行之，事必有成。”
十月
初七日，闽浙总督郭世隆疏奏，英圭黎夹板船遭风飘至海岸，命善加抚恤，乘时发还。
许科道官以风闻题参。初八日，命嗣后各省督、抚、将军、提、镇以下，教官、典史、千把总以上，官吏贤否，若有关系民生者，许科道官以风闻入奏倘怀私怨，互相朋比，受嘱托者，国法自在。
李柟疏言九卿会议事。左都御史李柟疏言：“凡有会议仅于前一日薄暮传知，次日即行齐集，惟主稿者及臣衙门先有科抄揭帖，余皆不详事之端委，齐集时止将看语宣读一遍，诸臣仓卒闻之，安有良策，大半就主稿者之议，唯唯画题而散。是虽会而未尝议也。臣请自后内阁于前一日传知，容诸臣略加审度，次日会议。至会议日期，除患病者竟不必列名，有托故不到及倩人画题等弊，概行申饬。”十八日，下部议行。
十二月
琼州黎民起事失败。上年十二月初十日，以文武官员遣人往广东琼州(今海南岛)采取花梨沉香、婪索滋扰，黎人王镇邦等率众起事，攻打宝停等营。初二日，两广总督石琳题报，即被平息。总督石琳、巡抚肖永藻、提督殷化行等俱降革有差。
