3院31所是代指某航天科技工程第三研究院第三十一科研所的意思。因为很多科研项目涉及保密，都是用数字来代替单位名称，如一院二院或301所等等，这些涉密的都要以数字来表示，以防泄密，这样可以起到保密作用也可区分这些单位而不会搞错。