准格尔旗位于鄂尔多斯市东部,库布齐沙漠东南端。北与包头市、东与呼和浩特市隔黄河相望,东南、南部与山西省的偏关县与河曲县以黄河为界,西南与陕西省的府谷县隔长城接壤,西部与伊金霍洛旗、东胜区、达拉特旗搭界。准格尔旗位于东经110°05′—110°27′、北纬39°16′—40°20′,总面积7692平方公里。