多菌灵主要用于植物，而em菌主要用于动物。

多菌灵：对预防和防治由多种病菌引起的植物病害，有很大的作用和效果，喷施后，经过茎叶内吸收传导，使植物茎叶产生菌类抗体，增强对菌类的抗病性，从而预防植物被病菌侵蚀和传染，避免病菌在茎叶滋生，达到预防效果，让植物减少病菌侵害，正常生长。

em菌是一种混合菌，包括光合菌、酵母菌、乳酸菌等有益菌类。它的主要作用是用于食品添加，养殖病害防治，土壤改良、生根壮苗、污水治理等。用途是促进动物生长，提高饲料利用率，降低饲养成本，缩短养殖周期。消除污染，改善饲养环境，降解水体的氨态氮、沼气、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质。