携程是事业部制组织机构，组织架构为五大事业部，具体就是酒店事业部、机票事业部、无线事业部、旅游度假事业部、商旅管理事业部。

携程最新的组织架构为五大事业部，分别由副总裁级别的高层亲自负责。

其中，酒店事业部由高级副总裁孙茂华负责，机票事业部由副总裁李小平负责，无线事业部由副总裁江浩负责，旅游度假事业部由副总裁郭东杰负责，商旅管理事业部由副总裁方继勤负责。